Los trabajos de la Organización en el tema de derechos humanos se llevan a cabo por una serie de órganos. En la investigación sobre cuestiones de derechos humanos debe hacerse una distinción clara entre los órganos basados en la Carta de la Organización y los órganos basados en los tratados.
El Consejo de Derechos Humanos y su predecesora, la Comisión de Derechos Humanos, llamados "basados en la Carta de la Organización", son establecidos por las resoluciones de los órganos principales de las Naciones Unidas y aprobados por la Carta de la ONU.
Los recientes órganos basados en la Carta son el Consejo de Derechos Humanos y sus subsidiarios, incluidos el Grupo de Trabajo sobre el Examen Periódico Universal y el Comité Consultivo.
Anteriormente, los órganos basados en la Carta eran formados por la Comisión de Derechos Humanos y sus subsidiarios, incluida la Subcomisión de Promoción y Protección de los Derechos Humanos.
Los Procedimientos Especiales tales como las labores de los Relatores Especiales, se han llevado a cabo desde 1947, informando primero a la Comisión y posteriormente al Consejo.
Durante su sexagésimo período de sesiones, la Asamblea General aprobó el Documento Final de la Cumbre Mundial en su resolución 60/1 del 16 de septiembre de 2005, solicitando además fortalecer los mecanismos de derechos humanos de la ONU. Posteriormente, esto dió origen a la creación del Consejo de Derechos Humanos.
El Consejo de Derechos Humanos tiene la responsabilidad de fortalecer la promoción y la protección de los derechos humanos a nivel mundial, así como hacer frente a posibles situaciones de violaciónes a los derechos humanos y a elaborar sus recomendaciones pertinentes.
La resolución de la Asamblea General 60/251 del 15 de marzo de 2006, estableció que el Consejo de Derechos Humanos solicite un examen periódico universal sobre el cumplimiento de las obligaciones y compromisos de derechos humanos de cada Estado. La resolución 5/1 del 18 de junio de 2007 del Consejo de Derechos Humanos, "Construcción institucional del Consejo de Derechos Humanos de las Naciones Unidas", describe los elementos importantes del Examen Periódico Universal.
El Comité Asesor del Consejo de Derechos Humanos es un órgano de expertos que funciona como un centro de estudios para el Consejo.
El Consejo de Derechos Humanos tiene bajo su responsabilidad los Procedimientos Especiales, incluidos los que originalmente estableció la Comisión de Derechos Humanos.
Los mecanismos de los Procedimientos Especiales [en] incluyen a:
Los Procedimientos Especiales investigan, debaten e informan sobre cuestiones específicas de derechos humanos bajo el mandato de un país o de un mandato temático.
La Comisión de Derechos Humanos es subsidiaria del Consejo Económico y Social; sus trabajos concluyeron en la ultima sesión durante el Sexagésimo Segundo periodo de sesiones, el 27 de marzo de 2006; su labor es reanudada por el Consejo de Derechos Humanos.
La Subcomisión de Promoción y Protección de los Derechos Humanos fue la base subsidiaria de la Comisión de Derechos Humanos.
A través de los años, los grupos de trabajo ad hoc han informado a la Comisión y a la Subcomisión.
Un considerable número de informes son presentados a la Comisión y a la Subcomisión por los Procedimientos Especiales, como los de los Grupos de Trabajo y los de los Relatores Especiales. Estos a su vez se presentan al Consejo de Derechos Humanos y a sus subsidiarios. Ver arriba para más detalles.